Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD3Q0VAK6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms