Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP4F3Q08477 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms