Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FMODQ06828 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FMODQ06828 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FMODQ06828 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FMODQ06828 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms