Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNEQ04844 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms