Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC10Q01780 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms