Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA5Q01523 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA5Q01523 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA5Q01523 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
DEFA5Q01523 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA5Q01523 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms