Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYBPC1Q00872 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms