Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK3Q00526 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms