Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms