Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UFM1P61960 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFM1P61960 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UFM1P61960 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFM1P61960 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms