Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERV-K104P61576 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms