Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms