Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms