Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP7P55210 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP7P55210 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP7P55210 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP7P55210 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP7P55210 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP7P55210 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP7P55210 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP7P55210 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms