Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms