Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPAP49450 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPAP49450 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPAP49450 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPAP49450 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPAP49450 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPAP49450 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPAP49450 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPAP49450 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPAP49450 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPAP49450 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPAP49450 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPAP49450 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPAP49450 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms