Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms