Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA4P43681 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA4P43681 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms