Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR4A2P43354 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR4A2P43354 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms