Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD52P43351 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms