Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP2P42575 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP2P42575 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP2P42575 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP2P42575 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP2P42575 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms