Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms