Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms