Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms