Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB2P29033 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJB2P29033 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJB2P29033 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJB2P29033 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB2P29033 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms