Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms