Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA2P26232 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms