Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMA1P25786 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms