Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms