Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RCC1P18754 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RCC1P18754 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms