Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL2P13500 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL2P13500 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms