Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms