Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GLI4P10075 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GLI4P10075 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms