Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PKHD1P08F94 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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PKHD1P08F94 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PKHD1P08F94 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PKHD1P08F94 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PKHD1P08F94 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PKHD1P08F94 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PKHD1P08F94 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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