Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGAVP06756 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms