Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGAP02671 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGAP02671 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGAP02671 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGAP02671 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FGAP02671 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGAP02671 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms