Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTL6BO94805 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms