Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms