Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNKO75909 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNKO75909 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNKO75909 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms