Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTNBO60941 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTNBO60941 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTNBO60941 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTNBO60941 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTNBO60941 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTNBO60941 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTNBO60941 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTNBO60941 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTNBO60941 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTNBO60941 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTNBO60941 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTNBO60941 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTNBO60941 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms