Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX16O60231 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DHX16O60231 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX16O60231 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX16O60231 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX16O60231 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms