Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms