Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ3O43525 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms