Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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