Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PODXLO00592 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PODXLO00592 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PODXLO00592 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PODXLO00592 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PODXLO00592 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PODXLO00592 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms