Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATL2C9JE40 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms