Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISM1B1AKI9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ISM1B1AKI9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms