Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms