Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms