Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00473A8K010 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms